Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ECSITQ9BQ95 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms