Protein–RNA interactions for Protein: Q99929

ASCL2, Achaete-scute homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL2Q99929 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASCL2Q99929 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL2Q99929 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms