Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms