Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM209Q96SK2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms