Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8L2Q96SF2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCT8L2Q96SF2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT8L2Q96SF2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT8L2Q96SF2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT8L2Q96SF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT8L2Q96SF2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT8L2Q96SF2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms