Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIGSQ96S52 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIGSQ96S52 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms