Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP5Q96RT8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP5Q96RT8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms