Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF3Q96PU9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms