Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRERF1Q96PN7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRERF1Q96PN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
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