Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEUROD6Q96NK8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD6Q96NK8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms