Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM227BQ96M60 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms