Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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