Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALPK3Q96L96 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK3Q96L96 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms