Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms