Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms