Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP6Q96FZ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP6Q96FZ7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms