Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT43Q96FT9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT43Q96FT9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms