Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX11Q96FC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX11Q96FC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX11Q96FC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms