Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms