Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCN3Q96D15 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms