Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF34Q969K3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RNF34Q969K3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms