Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAMP4Q969E2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAMP4Q969E2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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