Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4DQ92854 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms