Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF516Q92618 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF516Q92618 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF516Q92618 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF516Q92618 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms