Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC4Q8WW27 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC4Q8WW27 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms