Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP4Q8TDF6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms