Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATJQ8NI35 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATJQ8NI35 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms