Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms