Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPTSSBQ8NFR3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPTSSBQ8NFR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms