Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF397Q8NF99 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF397Q8NF99 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms