Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP18Q8NEJ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DUSP18Q8NEJ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms