Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC197Q8NCU1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms