Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PNLDC1Q8NA58 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms