Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTC29Q8NA56 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms