Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FSIP1Q8NA03 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FSIP1Q8NA03 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms