Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD53Q8N9V6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms