Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms