Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBR7Q8N806 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBR7Q8N806 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms