Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CLDN19Q8N6F1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CLDN19Q8N6F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN19Q8N6F1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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