Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVOPQ8N4V2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVOPQ8N4V2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms