Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLF2Q8IX21 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms