Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms