Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A9Q8IVB4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms