Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PASD1Q8IV76 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PASD1Q8IV76 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms