Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM135Q86UB9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM135Q86UB9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM135Q86UB9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms