Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC3Q7Z5M5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms