Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE3BQ7Z3V4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms