Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD4Q7Z3J3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD4Q7Z3J3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD4Q7Z3J3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.9 ms