Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP54Q7Z3B4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP54Q7Z3B4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms