Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NLRC3Q7RTR2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NLRC3Q7RTR2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms